Khi cơn bão số 3 tiến gần đảo Hải Nam (Trung Quốc) vào ngày 4/9, Trung tâm Dự báo Khí tượng Thủy văn Quốc gia đã đưa ra dự báo về hai trường hợp có thể xảy ra. Thứ nhất, bão đi vào phía Bắc đảo Hải Nam, sau đó đi vào phía Bắc vịnh Bắc Bộ. Với kịch bản này, bão ít suy yếu hơn do đi qua một vùng có địa hình tương đối bằng phẳng. Thứ hai, bão đi qua phía Nam đảo Hải Nam vào phía Nam vịnh Bắc Bộ. Với kịch bản này, bão sẽ suy yếu nhiều hơn do ma sát với địa hình núi cao của đảo.

Ngày 6/9, bão Yagi đã đi theo một kịch bản bất lợi nhất khi tâm bão men theo khu vực eo biển giữa đảo Hải Nam và bán đảo Lôi Châu của Trung Quốc. Vì vậy, khi vào vịnh Bắc Bộ trong đêm 6/9, cấu trúc bão vẫn ổn định với cường độ bão không suy giảm đáng kể. Sức gió mạnh nhất vùng gần tâm bão mạnh cấp 15, giật cấp 17 trên vịnh Bắc Bộ.

Bão Yagi đổ bộ đất liền theo kịch bản bất lợi nhất.

Khi hoạt động trên vịnh Bắc Bộ, nhờ điều kiện mặt biển rất ấm, cường độ bão không suy giảm đáng kể, thậm chí có thời điểm mạnh trở lại. Khi áp sát bờ biển Hải Phòng - Quảng Ninh trong trưa 7/9, bão vẫn duy trì cường độ cấp 13, giật cấp 16, được nhận định có thể là cơn bão mạnh nhất đổ bộ vào miền Bắc nước ta trong 50 năm qua.

Sáng 7/9, khi quần thảo khu vực vịnh Bắc Bộ và các tỉnh ven biển miền Bắc, bão đã gây ra gió mạnh dữ dội. Đảo Cô Tô có gió mạnh cấp 13, giật cấp 16; đảo Bạch Long Vĩ có gió mạnh cấp 13, giật cấp 14. Trên đất liền, khu vực Cửa Ông (Quảng Ninh) có gió mạnh cấp 12, giật cấp 14. Khoảng 15h ngày 7/9, tâm bão số 3 đi vào đất liền các tỉnh Quảng Ninh - Hải Phòng. Sức gió mạnh nhất vùng gần tâm bão mạnh cấp 12-13. Mưa to, gió rất mạnh khiến nhiều nhà bị tốc mái, biển quảng cáo, cây cối bị quật ngã, nhiều khu vực mất điện trên diện rộng... Trong 3 giờ tới, bão di chuyển theo hướng Tây Tây Bắc, tốc độ khoảng 15-20 km/giờ.

Vùng đổ bộ của bão Yagi cũng theo kịch bản ít mong muốn, khi bão có sự dịch chuyển nhẹ xuống phía Nam so với nhận định, gần hơn với đồng bằng Bắc Bộ dù khu vực tâm bão vẫn là Hải Phòng - Quảng Ninh. Với kịch bản này, bão ít suy yếu hơn khi vào sâu đất liền nước ta do đi qua khu vực bằng phẳng hơn, đồng thời cũng gây ra tác động nghiêm trọng hơn, rộng lớn hơn.

Dự báo, chiều và tối 7/9 là thời gian bão tác động dữ dội nhất ở khu vực Đông Bắc Bộ và Thanh Hóa với gió giật mạnh, mưa rất lớn. Sang đêm nay và ngày mai, bão suy yếu và dịch chuyển qua Tây Bắc Bộ. Khu vực này ít chịu khả năng của gió giật mạnh nhưng sẽ đón mưa lớn kéo dài, đỉnh điểm từ đêm 7/9 đến đêm 8/9, gây nguy cơ rất cao về lũ quét, sạt lở đất và ngập úng diện rộng.